RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	ACSM1	Q08AH1	577 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	IKZF1	Q13422	519 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	DUX4	Q9UBX2	424 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	TG	P01266	2768 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	MAGEB3	O15480	346 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFA7	O95182	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	KNG1	P01042	644 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	CD1A	P06126	327 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	LIPF	P07098	398 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	CEL	P19835	753 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	AMY2B	P19961	511 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	PPP3R1	P63098	170 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148		Q499Y3	187 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	MIDN	Q504T8	468 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	THRSP	Q92748	146 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	SDSL	Q96GA7	329 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	CITED1	Q99966	193 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TOX4	O94842	621 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CAV3	P56539	151 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	IRF3	Q14653	427 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	SPHAR	Q15513	63 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	MED22	Q15528	200 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	DGUOK	Q16854	277 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF561	Q8N587	486 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	SGCD	Q92629	289 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RFT1	Q96AA3	541 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	SPACA5	Q96QH8	159 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CKLF	Q9UBR5	152 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV1-69	P01742	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TFF1	P04155	84 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	SELL	P14151	372 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	FST	P19883	344 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	BPIFB3	P59826	476 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	KISS1	Q15726	138 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	LHX4	Q969G2	390 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	OR5M11	Q96RB7	305 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148		A0A0U1RQK1	487 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV4-59	P01825	116 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFB7	P17568	137 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	BCL3	P20749	454 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PRDX2	P32119	198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CAPZA1	P52907	286 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	DOC2B	Q14184	412 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CD177	Q8N6Q3	437 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	OR14A2	Q96R54	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	GPER1	Q99527	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1B0GUS0	222 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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