RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 TAS2R60P59551 318 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 RAP1BP61224 184 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 LCN6P62502 163 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 RAP1AP62834 184 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 MALLQ13021 153 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 IKZF1Q13422 519 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 OR5D14Q8NGL3 314 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 OR4K15Q8NH41 348 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 OR51F2Q8NH61 342 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 ADGRG7Q96K78 797 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 BCL2L14Q9BZR8 327 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 MYOTQ9UBF9 498 aa3.45□□□□□ -1.86
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ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A087WUJ7 227 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 OR2M5A3KFT3 312 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 FITM1A5D6W6 292 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF587BE7ETH6 402 aa3.45□□□□□ -1.86
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ANKRD28-213ENST00000498524 FAM157CP0CG43 387 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 COL8A1P27658 744 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 P2RY4P51582 365 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 F2RL1P55085 397 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 TAS2R46P59540 309 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC35A1P78382 337 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 VWA1Q6PCB0 445 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 PLPPR2Q96GM1 343 aa3.45□□□□□ -1.86
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ANKRD28-213ENST00000498524 TTTY12Q9BZ98 90 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 PLK3Q9H4B4 646 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 IGF2RP11717 2491 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1W2PPV9 198 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 OR6C68A6NDL8 312 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 M0QZK8 103 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 NKX2-2O95096 273 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 COX6A1P12074 109 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC2A5P22732 501 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 CALCRP30988 508 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 APLNRP35414 380 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 GNMTQ14749 295 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 PRTGQ2VWP7 1150 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM225Q6GV28 225 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 RTL6Q6ICC9 239 aa3.45□□□□□ -1.86
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ANKRD28-213ENST00000498524 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF611Q8N823 705 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 C4orf45Q96LM5 186 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM234AQ9H0X4 552 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 SEC61A2Q9H9S3 476 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 U3KQA8 63 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM74A7A6NL05 159 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 SULT2B1O00204 365 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC31A2O15432 143 aa3.44□□□□□ -1.86
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