RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BDP58876 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BCP62807 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 GUK1Q16774 197 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KIRREL1Q96J84 757 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RCE1Q9Y256 329 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SHISA3A0PJX4 238 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 XKRY2A2RUG3 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 AQP7O14520 342 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CXCL13O43927 109 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF432O94892 652 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SYNGR4O95473 234 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHG1P01857 330 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T7P0C7T2 308 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 APLNRP35414 380 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 AKR1C3P42330 323 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 BIDP55957 195 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CLDN15P56746 228 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5I1Q13606 314 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC17A1Q14916 467 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T27Q8NH04 317 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PHB2Q99623 299 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 B9D1Q9UPM9 204 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R036 132 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2C1O95371 312 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MT-ND5P03915 603 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TK1P04183 234 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PGA4P0DJD7 388 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PGA3P0DJD8 388 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF616Q08AN1 781 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST3H3Q16695 136 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KDM8Q8N371 416 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM45BQ96B21 275 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 GP6Q9HCN6 339 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MED29Q9NX70 200 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RAXQ9Y2V3 346 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF716A6NP11 495 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 H7C1C5 153 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RAMP1O60894 148 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 GYPBP06028 91 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CST2P09228 141 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 UCHL1P09936 223 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LIMS3P0CW19 117 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LIMS4P0CW20 117 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PYCR1P32322 319 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CLDN12P56749 244 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CLRN1P58418 232 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LCN6P62502 163 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HTD2P86397 168 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PMP22Q01453 160 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 BDH1Q02338 343 aa6.31□□□□□ -1.4
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