RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491339.1

GABRE-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 2

Gene GABRE, Length 2,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-211ENST00000491339 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 A0A087WXM4 84 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CDK1P06493 297 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 PRKACBP22694 351 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 PRDX2P32119 198 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ATP1B3P54709 279 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ACSM1Q08AH1 577 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 KLRD1Q13241 179 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CHIAQ9BZP6 476 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 HES4Q9HCC6 221 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 HHLA2Q9UM44 414 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MEIOCA2RUB1 952 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 RGS10O43665 173 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ANGPTL7O43827 346 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 NDUFA7O95182 113 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 SAA4P35542 130 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 KIR3DL2P43630 455 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 POU3F4P49335 361 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 RBP2P50120 134 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 UBE2E1P51965 193 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 GALEQ14376 348 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CALHM1Q8IU99 346 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MKXQ8IYA7 352 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 BATF2Q8N1L9 274 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 OR5R1Q8NH85 324 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 SLAMF9Q96A28 289 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 SPSB1Q96BD6 273 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 C4orf36Q96KX1 117 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ALG8Q9BVK2 526 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 GLS2Q9UI32 602 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 A0A1W2PRD5 423 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 A0A1W2PRF3 423 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 A0A1W2PRM7 423 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 J3QLW9 94 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MYL12BO14950 172 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 GPR137BO60478 399 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 IGHV4-59P01825 116 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ISG15P05161 165 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CHRM2P08172 466 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ZNF19P17023 458 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 IER3P46695 156 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CCR9P51686 369 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ERVFRD-1P60508 538 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 UBE2V2Q15819 145 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MIDNQ504T8 468 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 RNLSQ5VYX0 342 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 FDX2Q6P4F2 183 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 UTS2BQ765I0 119 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 SYS1Q8N2H4 156 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CD177Q8N6Q3 437 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 Q8N7P7 452 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 OPALINQ96PE5 141 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 SLITRK2Q9H156 845 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms