RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 CATSPER2Q96P56 530 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 OR52A5Q9H2C5 316 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ASB7Q9H672 318 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 POFUT2Q9Y2G5 429 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 TRIP11Q15643 1979 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ERICH2A1L162 156 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 UBDO15205 165 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 NPPAP01160 153 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SEC11BP0C7V7 166 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2H1P32780 548 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 TUFMP49411 452 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 TRAM1Q15629 374 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SSX1Q16384 188 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 BSXQ3C1V8 233 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC6Q86X45 466 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ACBD4Q8NC06 268 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 YPEL4Q96NS1 127 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 PITX2Q99697 317 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SRRQ9GZT4 340 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 OR2S2Q9NQN1 319 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 TAC3Q9UHF0 121 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A7Q9Y694 548 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 MRC2Q9UBG0 1479 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 NRCAMQ92823 1304 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 CD300LBA8K4G0 201 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 COX7A2P2O60397 106 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 CXorf1O96002 111 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DMAP28067 261 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ACOT2P49753 483 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2NLQ5JXB2 153 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZT83 130 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 AHSA2Q719I0 299 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 PRNTQ86SH4 94 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 YIPF5Q969M3 257 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 CYTH2Q99418 400 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 THTPAQ9BU02 230 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP45Q9UL16 551 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A14Q9Y267 594 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 GMNCA6NCL1 334 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 RGS5O15539 181 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 NRASP01111 189 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 HRASP01112 189 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 KRASP01116 189 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 CELP19835 753 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 TEAD1P28347 426 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A1P30531 599 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA3P43357 314 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 GCLMP48507 274 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 Q499Y3 187 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 FA2HQ7L5A8 372 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINB11Q96P15 392 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 INIPQ9NRY2 104 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf90A8MZG2 172 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN34H7C241 214 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 K7EM74 188 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-19P01714 112 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 OR5AC1P0C628 307 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 IMPA1P29218 277 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 GDI2P50395 445 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 OR4D1Q15615 310 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 ACTBL2Q562R1 376 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 TTMPQ5BVD1 217 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00596Q86U02 117 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 BIRC8Q96P09 236 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 PEBP4Q96S96 227 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 MIA3Q5JRA6 1907 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 CHD1O14646 1710 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 CDIPTO14735 213 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 PRTN3P24158 256 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB9P28065 219 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 CD164Q04900 197 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 BAXQ07812 192 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-212ENST00000491302 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
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