RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PP11	408 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR1	O75083	606 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RAD51D	O75771	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFSF13	O75888	250 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS11	O94810	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GLA	P06280	429 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CBR1	P16152	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GNB3	P16520	340 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CXCL3	P19876	107 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CHAT	P28329	748 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	APLNR	P35414	380 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R46	P59540	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GNG2	P59768	71 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	P2RY6	Q15077	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MDP1	Q86V88	176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR137	Q96N19	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PECR	Q9BY49	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	BANF2	Q9H503	90 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PTPRB	P23467	1997 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0B4J2A0	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		B5MCH6	92 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FABP7	O15540	132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SMPD2	O60906	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PDCD6	O75340	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	WISP2	O76076	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NGF	P01138	241 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FCER2	P06734	321 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CD79A	P11912	226 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB25	P24278	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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