RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 ARL9Q6T311 187 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 OR4F5Q8NH21 305 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 SGTBQ96EQ0 304 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 OR2V2Q96R30 315 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1B0GUS0 222 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM178BH3BS89 294 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 M0QZ24 198 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 SSNA1O43805 119 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 CRYBA1P05813 215 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 WNT2P09544 360 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 PPIAL4GP0DN37 164 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC6A6P31641 620 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 BLVRAP53004 296 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 DGCR2P98153 550 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 INSL4Q14641 139 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF626Q68DY1 528 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 FTMTQ8N4E7 242 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 GHSRQ92847 366 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 CMBLQ96DG6 245 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 TXNIPQ9H3M7 391 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 IL19Q9UHD0 177 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 MED31Q9Y3C7 131 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 SRRM5B3KS81 715 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFB6O95139 128 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 FGF2P09038 288 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 NR2C1P13056 603 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 IFI30P13284 250 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 FAUP35544 74 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 MMP16P51512 607 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 PCBD1P61457 104 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 GNB2P62879 340 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 RELBQ01201 579 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 ORAI1Q96D31 301 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 C4orf36Q96KX1 117 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 CITED1Q99966 193 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 GCM1Q9NP62 436 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 C1RLQ9NZP8 487 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 ARPC3O15145 178 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 TSC22D2O75157 780 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 CD3GP09693 182 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 ACSM4P0C7M7 580 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 KITLGP21583 273 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 OR10A3P58181 314 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 TSPAN5P62079 268 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 C1QL4Q86Z23 238 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 OR5AS1Q8N127 324 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 STPG2Q8N412 459 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 OR10AD1Q8NGE0 317 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 THEM6Q8WUY1 208 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 HAVCR1Q96D42 359 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 MNTQ99583 582 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 ALG12Q9BV10 488 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 CHIAQ9BZP6 476 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 RDH8Q9NYR8 311 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 STARD10Q9Y365 291 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 NPIPB13A6NJU9 1138 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 IFITM5A6NNB3 132 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 NPIPB4C9JG80 1138 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 E9PI62 339 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 L7N2F9 121 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 TIMM23O14925 209 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFA2O43678 99 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 PIP5K1CO60331 668 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 MSR1P21757 451 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 S100A11P31949 105 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGEF1-207ENST00000484547 HTR5AP47898 357 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms