RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GHSRQ92847 366 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 TNFRSF14Q92956 283 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 SNX22Q96L94 193 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 HMG20AQ9NP66 347 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GLS2Q9UI32 602 aa7.51□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 A0A0U1RQK1 487 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PPH5 198 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PRD5 423 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PRF3 423 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PRM7 423 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 TMEM82A0PJX8 343 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 PTGES3LE9PB15 166 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 CLDN34H7C241 214 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 SH2D1BO14796 132 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ALDOBP05062 364 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 CDK1P06493 297 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 CD2P06729 351 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 TMEM225BP0DP42 221 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 CCL3L1P16619 93 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 WNT4P56705 351 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ERVFRD-1P60508 538 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ZP1P60852 638 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GUCA2AQ02747 115 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 KLRD1Q13241 179 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ZNF146Q15072 292 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 SATL1Q86VE3 508 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 OR8H2Q8N162 312 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 TMEM106AQ96A25 262 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A28Q96A46 364 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 VCX3BQ9H321 246 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 RHOFQ9HBH0 211 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 NOX4Q9NPH5 578 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 SCN3BQ9NY72 215 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.5□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GABRPO00591 440 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 MYL12BO14950 172 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 NPFFO15130 113 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 PSPNO60542 156 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 CELP19835 753 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 MYF6P23409 242 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GABRR1P24046 479 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 LMO1P25800 156 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 UBE2E1P51965 193 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 EDDM3BP56851 147 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R43P59537 309 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 DOC2BQ14184 412 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ZNF273Q14593 569 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GRK1Q15835 563 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 RNLSQ5VYX0 342 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 HCP5Q6MZN7 132 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 C16orf87Q6PH81 154 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 PNKDQ8N490 385 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 PXT1Q8NFP0 134 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 MYDGFQ969H8 173 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 ORAI1Q96D31 301 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 GPER1Q99527 375 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 CHST6Q9GZX3 395 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SYN3-211ENST00000472027 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.49□□□□□ -1.21
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