RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 GSX2Q9BZM3 304 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 PLK3Q9H4B4 646 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 TNFSF18Q9UNG2 199 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 FAM25EA8MYX2 175 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 AHRRA9YTQ3 701 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 TRAPPC2LH3BP13 241 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 B3GALNT1O75752 331 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 OR2F2O95006 317 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 PGAM2P15259 253 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 COX5AP20674 150 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 SERPINF1P36955 418 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 GNG3P63215 75 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 OR2F1Q13607 317 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 Q6ZS49 121 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 LINC00596Q86U02 117 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 MTCH1Q9NZJ7 389 aa16.1■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 WISP2O76076 250 aa16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 CRHP06850 196 aa16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 RAB14P61106 215 aa16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 C9orf106Q8NAJ2 232 aa16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 DYRK2Q92630 601 aa16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 PKIBQ9C010 78 aa16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 LHX6Q9UPM6 363 aa16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 URB1O60287 2271 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 SMPD2O60906 423 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 CALCRP30988 508 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 ANKRD55Q3KP44 614 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 BRICD5Q6PL45 260 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 SLC51BQ86UW2 128 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 KCNRGQ8N5I3 272 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 BHLHE23Q8NDY6 225 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 TAAR6Q96RI8 345 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 CDH20Q9HBT6 801 aa16.08■□□□□ 0.17
NME4-210ENST00000468031 ZFHX4Q86UP3 3567 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 C5orf51A6NDU8 294 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 LYZL6O75951 148 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 PTGER4P35408 488 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 IL24Q13007 206 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 OR2T2Q6IF00 324 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 SLC22A25Q6T423 547 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 OR5M9Q8NGP3 310 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 THAP6Q8TBB0 222 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 LIME1Q9H400 295 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 RHOFQ9HBH0 211 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 KIF25Q9UIL4 384 aa16.08■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 LEUTXA8MZ59 168 aa16.07■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 LILRA1O75019 489 aa16.07■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 CELA3BP08861 270 aa16.07■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 PSMB6P28072 239 aa16.07■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa16.07■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa16.07■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 EXTL1Q92935 676 aa16.07■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 OR51B6Q9H340 312 aa16.07■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 SPACA1Q9HBV2 294 aa16.07■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 F8VVB4 439 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 F8VWA3 439 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 IFNA2P01563 188 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 CBR1P16152 277 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 PPP1CBP62140 327 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 IL13RA2Q14627 380 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 PDCD1Q15116 288 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 ESCO2Q56NI9 601 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 SGPP2Q8IWX5 399 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 SCARB1Q8WTV0 552 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 RDH8Q9NYR8 311 aa16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 FAM221AA4D161 298 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 SYNGR1O43759 233 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 NAPSAO96009 420 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 KNG1P01042 644 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 ZNF728P0DKX0 622 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 UCP3P55916 312 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 VWA1Q6PCB0 445 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 Q6ZPA2 131 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 Q6ZS92 163 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 PIK3IP1Q96FE7 263 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 CITED4Q96RK1 184 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 OR51I2Q9H344 312 aa16.05■□□□□ 0.16
NME4-210ENST00000468031 C1orf123Q9NWV4 160 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms