RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 DLGAP1O14490 977 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MAGEB3O15480 346 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ARHGEF9O43307 516 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IFNGP01579 166 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RPA2P15927 270 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IGHV1-2P23083 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CD79BP40259 229 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 HTR5AP47898 357 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 LCN6P62502 163 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 FMODQ06828 376 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CD47Q08722 323 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 GINS1Q14691 196 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ECSCRQ19T08 205 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 LRRC36Q1X8D7 754 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 THEM4Q5T1C6 240 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 C10orf128Q5T292 105 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ACSM5Q6NUN0 579 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 LEG1Q6P5S2 330 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SYT14Q8NB59 555 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR52E2Q8NGJ4 325 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR4K13Q8NH42 304 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RBP7Q96R05 134 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MBOAT4Q96T53 435 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 NMNAT3Q96T66 252 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PRRG3Q9BZD7 231 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SYT4Q9H2B2 425 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CRLF2Q9HC73 371 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 KLHL21Q9UJP4 597 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MED12LQ86YW9 2145 aa4.85□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 LYZL6O75951 148 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC2A10O95528 541 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SNAP29O95721 258 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RENP00797 406 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 HMGN1P05114 100 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 GSTT2P0CG29 244 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 GSTT2BP0CG30 244 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CTLA4P16410 223 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF3P17036 446 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IL32P24001 234 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CRABP1P29762 137 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 UGT2B10P36537 528 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PEX19P40855 299 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 TGFBR3Q03167 851 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IL24Q13007 206 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CRMP1Q14194 572 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 GABRA6Q16445 453 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 C12orf73Q69YU5 71 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF562Q6V9R5 426 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR6V1Q8N148 313 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CENPSQ8N2Z9 138 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ACBD4Q8NC06 268 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 NUP37Q8NFH4 326 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 STEAP2Q8NFT2 490 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR4F17Q8NGA8 305 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PLEKHA8Q96JA3 519 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RCHY1Q96PM5 261 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC38A2Q96QD8 506 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR4F4Q96R69 305 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PITX2Q99697 317 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RACGAP1Q9H0H5 632 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 VCXQ9H320 206 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 VCX3BQ9H321 246 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM38BQ9NVV0 291 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MBD2Q9UBB5 411 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa4.84□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PRPF4B-204ENST00000466185 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PRPF4B-204ENST00000466185 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.83□□□□□ -1.64
PRPF4B-204ENST00000466185 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa4.83□□□□□ -1.64
PRPF4B-204ENST00000466185 CIB4A0PJX0 185 aa4.83□□□□□ -1.64
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM183AA6NL82 134 aa4.83□□□□□ -1.64
PRPF4B-204ENST00000466185 LRRC30A6NM36 301 aa4.83□□□□□ -1.64
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