RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 PTH2RP49190 550 aa7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 HTR2CP28335 458 aa7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 MMP16P51512 607 aa7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 IL18Q14116 193 aa7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 PYDC2Q56P42 97 aa7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 WDR38Q5JTN6 314 aa7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 MBP02144 154 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 CEACAM3P40198 252 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 PSG7Q13046 419 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 SSX9Q7RTT3 188 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 WDR31Q8NA23 367 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 PHYHIPQ92561 330 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 YIPF5Q969M3 257 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 LURAP1Q96LR2 239 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 B4DSR2 109 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFS8O00217 210 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 LCN2P80188 198 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TAF9Q16594 264 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 NRGNQ92686 78 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM68Q96MH6 324 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00052Q96N35 136 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 CCL13Q99616 98 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 STUB1Q9UNE7 303 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 LRP5LA4QPB2 252 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 GYPAP02724 150 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 BRS3P32247 399 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TEX30Q5JUR7 227 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TEX261Q6UWH6 196 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 FAM122BQ7Z309 247 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC107Q8WV48 283 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 U3KQ87 197 aa7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM129A0AVI4 362 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TEX46H3BTG2 121 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 C19orf84I3L1E1 186 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 ALDOBP05062 364 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 CHRM2P08172 466 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 CDK5R1Q15078 307 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 RAB12Q6IQ22 244 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF525Q8N782 197 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 SSX3Q99909 188 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 COA4Q9NYJ1 87 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 NLKQ9UBE8 527 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 C1QBP02746 253 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 CCR9P51686 369 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 AP3S2P59780 193 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 ADIPOQQ15848 244 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 PLA1AQ53H76 456 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 NUP37Q8NFH4 326 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 RPEQ96AT9 228 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 SRD5A1P18405 259 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 MEOX2P50222 304 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.94□□□□□ -1.14
DDX39B-215ENST00000462256 RNF138Q8WVD3 245 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms