RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 GNB2P62879 340 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CBX1P83916 185 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 EFNB1P98172 346 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 FAM3AP98173 230 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ZNF92Q03936 586 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 TMED1Q13445 227 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ATP6AP1Q15904 470 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 TIGD6Q17RP2 521 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 NXNL2Q5VZ03 156 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OTPQ5XKR4 325 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PLBD1Q6P4A8 553 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 Q6ZSR3 168 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 NAA40Q86UY6 237 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SPATA24Q86W54 205 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR5AS1Q8N127 324 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 BHLHE23Q8NDY6 225 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR6N2Q8NGY6 317 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR8S1Q8NH09 359 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SGK3Q96BR1 496 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 REEP6Q96HR9 211 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CENPMQ9NSP4 180 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 DUX4Q9UBX2 424 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CLN8Q9UBY8 286 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 A0A0U1RQK1 487 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR5B21A6NL26 309 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 FAM183AA6NL82 134 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 E9PQ18 207 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 G3V2T6 193 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 P2RY10O00398 339 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PRYO14603 147 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 NDUFB8O95169 186 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 IGLV3-1P01715 115 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 HLA-DPB1P04440 258 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 RPSAP08865 295 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CLUP10909 449 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PSKH1P11801 424 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 FASP25445 335 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 POU1F1P28069 291 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 DUSP1P28562 367 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 GABRA5P31644 462 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 GNALP38405 381 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PRKXP51817 358 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 FGF12P61328 243 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 TWIST1Q15672 202 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 MPPED2Q15777 294 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SNAPC1Q16533 368 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 MICBQ29980 383 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 KLHL12Q53G59 568 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 C12orf73Q69YU5 71 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CPOQ8IVL8 374 aa3.49□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 GID4Q8IVV7 300 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms