RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF823P16415 610 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPV17P39210 176 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALDH3B1P43353 468 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP5J2P56134 94 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCBD1P61457 104 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HERV-K104P63124 156 aa7□□□□□ -1.29
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMELYQ99218 206 aa7□□□□□ -1.29
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CBLN4Q9NTU7 201 aa7□□□□□ -1.29
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTORP42345 2549 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM89A2RUT3 159 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC182A6NF36 153 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR6C6A6NF89 314 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF732B4DXR9 585 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F5H5K5 113 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OVOL3O00110 214 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNAP29O95721 258 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMGN1P05114 100 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC2A1P11166 492 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB39BQ96DA2 213 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXC2Q99958 501 aa6.99□□□□□ -1.29
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ETV7Q9Y603 341 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.98□□□□□ -1.29
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLRXP35754 106 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKXP51817 358 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1CBP62140 327 aa6.98□□□□□ -1.29
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR50Q13585 617 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIP10Q15642 601 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DOK1Q99704 481 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.98□□□□□ -1.29
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