RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 MPIP34949 423 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 BSGP35613 385 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SSR2P43308 183 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 CX3CR1P49238 355 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SULT1A2P50226 295 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 ATP1B3P54709 279 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 DHRS2Q13268 280 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SGCBQ16585 318 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 PRR22Q8IZ63 422 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 CDK20Q8IZL9 346 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 TEX29Q8N6K0 151 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 DOK4Q8TEW6 326 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 MITD1Q8WV92 249 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 THRSPQ92748 146 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 PMM1Q92871 262 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 OR14A2Q96R54 314 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SOX7Q9BT81 388 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 RNF126Q9BV68 326 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 HCAR1Q9BXC0 346 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 MED20Q9H944 212 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 UBQLN4Q9NRR5 601 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 A0A087WUJ7 227 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 A0A0A6YYH2 397 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 A0A1W2PPH5 198 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 A6NJ64 397 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 A6NLC8 198 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 CDC42EP2O14613 210 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SYT7O43581 403 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 GMFGO60234 142 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 LYPD3O95274 346 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 GPR75O95800 540 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 AIFM1O95831 613 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 THY1P04216 161 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 CD3DP04234 171 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SLC35E2P0CK97 266 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 CD37P11049 281 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 IL11P20809 199 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 DIO1P49895 249 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 CLDN15P56746 228 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 FXYD6P3P58550 94 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 OR2B8PP59922 312 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 RAP1AP62834 184 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 FUT5Q11128 374 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 HSPB3Q12988 150 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 CRMP1Q14194 572 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 MEF2DQ14814 521 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 TP53I3Q53FA7 332 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SLC22A25Q6T423 547 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 HEPN1Q6WQI6 88 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SSX6Q7RTT6 188 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 SNX33Q8WV41 574 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 GALNT14Q96FL9 552 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC6-210ENST00000441703 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.4 ms