RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 ELOBQ15370 118 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SLC38A9Q8NBW4 561 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 YPEL4Q96NS1 127 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF160Q9HCG1 818 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 GFOD1Q9NXC2 390 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 AK3Q9UIJ7 227 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC187A0A096LP49 1063 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CST7O76096 145 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CD63P08962 238 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SELLP14151 372 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NDUFB7P17568 137 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 UCP2P55851 309 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF429Q86V71 674 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 COMMD1Q8N668 190 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NAA60Q9H7X0 242 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KLRF1Q9NZS2 232 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KLHL13Q9P2N7 655 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 FBLP22087 321 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ATP6V0CP27449 155 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RAB1AP62820 205 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KHDC3LQ587J8 217 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 THEM4Q5T1C6 240 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SLC7A11Q9UPY5 501 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 MMACHCQ9Y4U1 282 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 K7N7A8 449 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 IGHG1P01857 330 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF43P17038 809 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 OR2T2Q6IF00 324 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 FAM180AQ6UWF9 173 aa13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SERPINE3A8MV23 424 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ST8SIA3O43173 380 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PGA4P0DJD7 388 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PGA3P0DJD8 388 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RNF4P78317 190 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 OR2AE1Q8NHA4 323 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF724A8MTY0 619 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HSD17B6O14756 317 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PPP1R2P9O14990 202 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PNLIPP16233 465 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SLC22A25Q6T423 547 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CADM4Q8NFZ8 388 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 UFSP2Q9NUQ7 469 aa13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ANKUB1A6NFN9 424 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 F10P00742 488 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 MTCP1P56278 107 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TLE1Q04724 770 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 C1QL4Q86Z23 238 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM123Q8N131 208 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SLC35G3Q8N808 338 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SLC2A9Q9NRM0 540 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 FGF21Q9NSA1 209 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 IGSF23A1L1A6 192 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NKX2-6A6NCS4 301 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DUX1O43812 170 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SPSB3Q6PJ21 355 aa13.42□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SSSCA1O60232 199 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DUSP1P28562 367 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 C17orf67Q0P5P2 114 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 GNMTQ14749 295 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PPA1Q15181 289 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PIGYQ3MUY2 71 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PLXDC1Q8IUK5 500 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SSC4DQ8WTU2 575 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM171Q8WVE6 324 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 FRZBQ92765 325 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HLA-CQ95604 372 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 GALNT14Q96FL9 552 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TP53RKQ96S44 253 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ALKBH4Q9NXW9 302 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SRP19P09132 144 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TRGC1P0CF51 173 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 LIAT1Q6ZQX7 453 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 OIT3Q8WWZ8 545 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 OPA3Q9H6K4 179 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 MOB1AQ9H8S9 216 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 UCK1Q9HA47 277 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CRLF2Q9HC73 371 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 H3BMH7 237 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CLDN17P56750 224 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIKESHIQ53FT3 197 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SDK2Q58EX2 2172 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 GPR157Q5UAW9 335 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 FAM69BQ5VUD6 431 aa13.41□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF587BE7ETH6 402 aa13.4□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 FOSL2P15408 326 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms