RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 DUSP1P28562 367 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 POU3F4P49335 361 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ZNF146Q15072 292 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ZNF626Q68DY1 528 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 LIAT1Q6ZQX7 453 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ENTHD1Q8IYW4 607 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 FAM58AQ8N1B3 248 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ACBD7Q8N6N7 88 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 TPRX1Q8N7U7 411 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 PELI1Q96FA3 418 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ZNF714Q96N38 554 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 CHST6Q9GZX3 395 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 HTR1AP08908 422 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 CALCBP10092 127 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 GABRB1P18505 474 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 PRKACBP22694 351 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 RAB13P51153 203 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 CCR9P51686 369 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 HERPUD1Q15011 391 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 GRK1Q15835 563 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 PLA1AQ53H76 456 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ZFP1Q6P2D0 407 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 RNF144BQ7Z419 303 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 CBR4Q8N4T8 237 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 OR51A4Q8NGJ6 313 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 LGALS12Q96DT0 336 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 MALSU1Q96EH3 234 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 FOXJ3Q9UPW0 622 aa22.01■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 hADV38S2A0JD32 116 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 OR4C45A6NMZ5 311 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 J3QLW9 94 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ZNF19P17023 458 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ZNF20P17024 532 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 GABRR1P24046 479 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 PEX2P28328 305 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 PDZK1IP1Q13113 114 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 C2orf68Q2NKX9 166 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 OR4S1Q8NGB4 309 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 C4orf36Q96KX1 117 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 OPALINQ96PE5 141 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 HHLA2Q9UM44 414 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 LINC00312Q9Y6C7 94 aa22■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 CYB5AP00167 134 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 PRKACAP17612 351 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 SSX2Q16385 188 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 C11orf88Q6PI97 169 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 OR2T6Q8NHC8 308 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 RFT1Q96AA3 541 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 SPSB1Q96BD6 273 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 TCF19Q9Y242 345 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 TGP01266 2768 aa21.99■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 IGKV1D-12P01611 117 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 OR3A1P47881 315 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 SNU13P55769 128 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 FAM189A2Q15884 450 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 SPIN3Q5JUX0 258 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 Q6ZTK2 550 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 CFHR4Q92496 578 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 SPACA5Q96QH8 159 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 HMG20AQ9NP66 347 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 GMPPBQ9Y5P6 360 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 SNTNA6NMZ2 147 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 MGST3O14880 152 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 MT-ND2P03891 347 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 CSF1P09603 554 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ACTA2P62736 377 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ACTG2P63267 376 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 LHFPL3Q86UP9 236 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 KLHDC1Q8N7A1 406 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 OR13C3Q8NGS6 347 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ZNF649Q9BS31 505 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 CDCA4Q9BXL8 241 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ZNF702PQ9H963 129 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 MYRFQ9Y2G1 1151 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 SESN1Q9Y6P5 492 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 A6NDX4 124 aa21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 DBTP11182 482 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ERP29P30040 261 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 GALEQ14376 348 aa21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ZNF676Q8N7Q3 588 aa21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 OR13C9Q8NGT0 318 aa21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 SLC29A1Q99808 456 aa21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ALG8Q9BVK2 526 aa21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 GLS2Q9UI32 602 aa21.96■■□□□ 1.11
LMO1-202ENST00000428101 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa21.95■■□□□ 1.1
LMO1-202ENST00000428101 MMP23AO75900 390 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms