RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10.53□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A11Q9UPY5 501 aa10.53□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX5Q9Y5X3 404 aa10.53□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL1P22362 96 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR1DP28221 377 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTR3P61158 418 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB121Q5J5C9 76 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35F2Q8IXU6 374 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STMN2Q93045 179 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOL4Q9BPW4 351 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST6Q9GZX3 395 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INPP5EQ9NRR6 644 aa10.52□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INMTO95050 263 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLIC3O95833 236 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAND1O96004 215 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHA1P01876 353 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPLP06858 475 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKACGP22612 351 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD24P25063 80 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEX2P28328 305 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRK1Q15835 563 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52N4Q8NGI2 321 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MNTQ99583 582 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCLRE1BQ9H816 532 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL36RNQ9UBH0 155 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TENM3Q9P273 2699 aa10.51□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AQP12BA6NM10 295 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E9PQ18 207 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKYO43930 277 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GATBO75879 557 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP23AO75900 390 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2F2O95006 317 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VSIG8P0DPA2 414 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABRR1P24046 479 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRS3P32247 399 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUT6P51993 359 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRISP1P54107 249 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF91Q05481 1191 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2V2Q15819 145 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ODF4Q2M2E3 257 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf146Q5VVC0 180 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLX4IPQ5VYV7 408 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A26Q70HW3 274 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGFL6Q8IUX8 553 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AQP12AQ8IXF9 295 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST5Q9GZS9 411 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRL4Q9HBW9 690 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPM3Q9P2X0 92 aa10.5□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BSH0 61 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT7O43581 403 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSPNO60542 156 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGDIBP52566 201 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RX3P56373 397 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD69Q07108 199 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8IYB0 196 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENTHD1Q8IYW4 607 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00482Q8N8I6 264 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF596Q8TC21 504 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC9Q8WXX5 260 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPF1Q92782 380 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BORCS8Q96FH0 119 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B9D2Q9BPU9 175 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRRG3Q9BZD7 231 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLN6Q9NWW5 311 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R129 80 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGST3O14880 152 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPP14O95059 124 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERP29P30040 261 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR3A1P47881 315 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BDH1Q02338 343 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXNL2Q5VZ03 156 aa10.49□□□□□ -0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52W1Q6IF63 320 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms