RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 PEX2P28328 305 aa22.53■■□□□ 1.2
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ANKRD54-203ENST00000407117 GALEQ14376 348 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF146Q15072 292 aa22.53■■□□□ 1.2
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ANKRD54-203ENST00000407117 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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ANKRD54-203ENST00000407117 NEK6Q9HC98 313 aa22.53■■□□□ 1.2
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ANKRD54-203ENST00000407117 OR13C3Q8NGS6 347 aa22.52■■□□□ 1.2
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ANKRD54-203ENST00000407117 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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ANKRD54-203ENST00000407117 KIR2DS4P43632 304 aa22.5■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 OR52N4Q8NGI2 321 aa22.5■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 SLC29A1Q99808 456 aa22.49■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 DUSP1P28562 367 aa22.48■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa22.48■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM118AQ9NWS6 357 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 ERVK13-1Q9NX77 482 aa22.48■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 SH2D1BO14796 132 aa22.47■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 OR4S1Q8NGB4 309 aa22.47■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 COMMD4Q9H0A8 199 aa22.47■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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ANKRD54-203ENST00000407117 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNAB3O43448 404 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 IGKV1D-12P01611 117 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC159P0C7I6 412 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 OR3A1P47881 315 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 EFNB2P52799 333 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 P2RX3P56373 397 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54-203ENST00000407117 KLHL22Q53GT1 634 aa22.46■■□□□ 1.19
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