RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 S100A7P31151 101 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 RAB7AP51149 207 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 RUNX1Q01196 453 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 GABRA6Q16445 453 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ATP6V1FQ16864 119 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 VAMP5O95183 116 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DEFA4P12838 97 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 HTR1DP28221 377 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CSN1S1P47710 185 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 A6NDN8 102 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TLCD2A6NGC4 264 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZNF217O75362 1048 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 SHHQ15465 462 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 SPSB1Q96BD6 273 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ACY3Q96HD9 319 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 IP6K3Q96PC2 410 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPZ6 126 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DHHO43323 396 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 WDR34Q96EX3 536 aa8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 C12orf49Q9H741 205 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SLC26A1Q9H2B4 701 aa8.68□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 NEURL1O76050 574 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PNLIPRP2P54317 469 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 RHBDL1O75783 438 aa8.68□□□□□ -1.02
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