RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1QL2Q7Z5L3 287 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEACAM19Q7Z692 300 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNRF1Q8ND25 227 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LY6G5BQ8NDX9 201 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C8orf46Q8TAG6 207 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NANPQ8TBE9 248 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D15Q8TC07 691 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100A13Q99584 98 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UQCC2Q9BRT2 126 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCTN5Q9BTE1 182 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLITRK2Q9H156 845 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL36GQ9NZH8 169 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUX4Q9UBX2 424 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OPN4Q9UHM6 478 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PPK0 400 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCRL2O00421 344 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCN3O75636 299 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HAND1O96004 215 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SFTPBP07988 381 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKACAP17612 351 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR176Q14439 515 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIR3DL3Q8N743 410 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHST4Q8NCG5 386 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM185AQ8NFB2 350 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5D13Q8NGL4 314 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R35Q8TAP8 253 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM203Q969S6 136 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ORAI1Q96D31 301 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM192AQ9GZU8 254 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL9Q9H1A3 318 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNTD2Q9H8S5 307 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR14J1Q9UGF5 321 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACANP16112 2415 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 K7N7A8 449 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH2D1BO14796 132 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INMTO95050 263 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNA2P01563 188 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TK1P04183 234 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAS1P04201 325 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SELLP14151 372 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFB7P17568 137 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRMP19623 302 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RANBP1P43487 201 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAPZA1P52907 286 aa12.65□□□□□ -0.38
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL13RA2Q14627 380 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RSU1Q15404 277 aa12.65□□□□□ -0.38
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM91Q6ZNR0 172 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF144BQ7Z419 303 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CMTM4Q8IZR5 234 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BATF2Q8N1L9 274 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JAGN1Q8N5M9 183 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UPRTQ96BW1 309 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNX22Q96L94 193 aa12.65□□□□□ -0.38
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GHRLQ9UBU3 117 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KPTNQ9Y664 436 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087WXM4 84 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PPH5 198 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF737O75373 536 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AVPP01185 164 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FSHBP01225 129 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSTBP04080 98 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMO1P25800 156 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMB9P28065 219 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR3A4PP47883 348 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BPIFB3P59826 476 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL10A1Q03692 680 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INSL4Q14641 139 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSX1Q16384 188 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLT8D1Q68CQ7 371 aa12.64□□□□□ -0.39
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00596Q86U02 117 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYPD6Q86Y78 171 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR8H2Q8N162 312 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR51T1Q8NGJ9 327 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF696Q9H7X3 374 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIVEP2P31629 2446 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGEA13PA6NCF6 341 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TFF1P04155 84 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBBP0CG47 229 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD37P11049 281 aa12.63□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTF2F2P13984 249 aa12.63□□□□□ -0.39
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