RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390394.3

TRBV20-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20-1, Length 413 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1-201ENST00000390394 MZT2AQ6P582 158 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 PHF21AQ96BD5 680 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 BATF3Q9NR55 127 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 RAB22AQ9UL26 194 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ETV7Q9Y603 341 aa8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 WNT9BO14905 357 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 DEGS1O15121 323 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 SIGLEC5O15389 551 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ADAM20O43506 726 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 FOXH1O75593 365 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF205O95201 554 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 HAND1O96004 215 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV1D-12P01611 117 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 GYPAP02724 150 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 GLAP06280 429 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 SFTPBP07988 381 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 PSG2P11465 335 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF44P15621 663 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 MGMTP16455 207 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 EGR1P18146 543 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 RAB6AP20340 208 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 NPBWR2P48146 333 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 KCNJ3P48549 501 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 GZMKP49863 264 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 GNB2P62879 340 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 IDNKQ5T6J7 187 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 HES5Q5TA89 166 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ISOC1Q96CN7 298 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 SDSLQ96GA7 329 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF488Q96MN9 340 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 IFT22Q9H7X7 185 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 CLN8Q9UBY8 286 aa8.09□□□□□ -1.11
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A1W2PPH5 198 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 SHISA3A0PJX4 238 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 RNF223E7ERA6 249 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 MPIG6BO95866 241 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGHV2-5P01817 119 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 WNT2P09544 360 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 VSIG8P0DPA2 414 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 FOSL1P15407 271 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 LMO1P25800 156 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 PITPNBP48739 271 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR10A3P58181 314 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 IKZF1Q13422 519 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM201AQ5SY85 155 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 RAB12Q6IQ22 244 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.08□□□□□ -1.12
TRBV20-1-201ENST00000390394 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms