RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 CLDN23Q96B33 292 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SSX3Q99909 188 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 WDR54Q9H977 334 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SDK2Q58EX2 2172 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 MASP2O00187 686 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 UMODP07911 640 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SPEM2Q0P670 501 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RSU1Q15404 277 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 CLEC9AQ6UXN8 241 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM123Q8N131 208 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 OR2AE1Q8NHA4 323 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 NAT6Q93015 286 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 MEMO1Q9Y316 297 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 A0A087X0M5 115 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0J9YW62 118 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1B0GV50 99 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1B0GX30 115 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 BTBD17A6NE02 478 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ANGPTL7O43827 346 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 CFIP05156 583 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 PET100P0DJ07 73 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 FGF5P12034 268 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 PRSS12P56730 875 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ARL6IP1Q15041 203 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 EXT1Q16394 746 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 TM2D1Q9BX74 207 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 CFAP54Q96N23 3096 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 COX6A1P12074 109 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF708P17019 499 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RPL12P30050 165 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 MAS1LP35410 378 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 IL11RAQ14626 422 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 BEND4Q6ZU67 534 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SULF2Q8IWU5 870 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 IMMP1LQ96LU5 166 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 PROK2Q9HC23 129 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 C9J4A7 227 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 CCL4P13236 92 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 FCGR2CP31995 323 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 PTGER4P35408 488 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H3AP68431 136 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 IL15RAQ13261 267 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RTL6Q6ICC9 239 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 NAXEQ8NCW5 288 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 MISP3Q96FF7 219 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 METTL9Q9H1A3 318 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf123Q9NWV4 160 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF727A8MUV8 499 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 K7EPK0 472 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 C1QL1O75973 258 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SOD3P08294 240 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 CYC1P08574 325 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM33P57088 247 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SPCS3P61009 180 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 TAF9Q16594 264 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SGPP2Q8IWX5 399 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 HLA-CQ95604 372 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 NTNG2Q96CW9 530 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 SRXN1Q9BYN0 137 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms