RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 TCN2P20062 427 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 RAB5CP51148 216 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF616Q08AN1 781 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 MALLQ13021 153 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 AKR7LQ8NHP1 331 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 FSCN3Q9NQT6 498 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 ST8SIA3O43173 380 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 XRCC2O43543 280 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 PRSS12P56730 875 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 RAB5BP61020 215 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 HERV-K104P61576 105 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 EGLN1Q9GZT9 426 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 TMED3Q9Y3Q3 217 aa15.8■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 FAM221AA4D161 298 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 NME2P1O60361 137 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 PMELP40967 661 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 CAMLGP49069 296 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 RBM11P57052 281 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 CARD18P57730 90 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 PCBD1P61457 104 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 PSG4Q00888 419 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 AAED1Q7RTV5 226 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 GGNQ86UU5 652 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 C2CD4CQ8TF44 421 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 C14orf79Q96F83 325 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 SGCZQ96LD1 299 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 FOXB1Q99853 325 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 OR2H1Q9GZK4 316 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 WFDC1Q9HC57 220 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 ARID1AO14497 2285 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 NTF4P34130 210 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 KCNJ3P48549 501 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 SRPXP78539 464 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 GUK1Q16774 197 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM211Q6ICI0 200 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 BRICD5Q6PL45 260 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 OR52M1Q8NGK5 317 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 OR14L1PQ8NHC6 308 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 SFT2D1Q8WV19 159 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 WNT5BQ9H1J7 359 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa15.79■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.78■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 MASP2O00187 686 aa15.78■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 ZFP82Q8N141 532 aa15.78■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 NAXEQ8NCW5 288 aa15.78■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.78■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 POM121Q96HA1 1249 aa15.78■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 PATE4P0C8F1 98 aa15.77■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 FOLR3P41439 243 aa15.77■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF92Q03936 586 aa15.77■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 OR11L1Q8NGX0 322 aa15.77■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 CLCC1Q96S66 551 aa15.77■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.77■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.77■□□□□ 0.12
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC85CA6NKD9 419 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 YKT6O15498 198 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 P04436 131 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 GLAP06280 429 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 FUT3P21217 361 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 AADACP22760 399 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 PTAFRP25105 342 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 CTAG1AP78358 180 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 CEACAM16Q2WEN9 425 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 AWAT1Q58HT5 328 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 SLC35G3Q8N808 338 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 OR4D5Q8NGN0 318 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 PILRBQ9UKJ0 227 aa15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0G2JMM0 328 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PPB8 328 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PRS3 328 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 KIR3DP1A8MWS1 328 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 CDS2O95674 445 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 PPYP01298 95 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 PRH1P02810 166 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 RGS19P49795 217 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 GNMTQ14749 295 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 RNF212Q495C1 297 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.76■□□□□ 0.11
SPNS3-201ENST00000355530 Q6ZPA2 131 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97 ms