RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 GMFBP60983 142 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TBC1D28Q2M2D7 210 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 MPV17LQ2QL34 196 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 LIN54Q6MZP7 749 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 VWA1Q6PCB0 445 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 BRICD5Q6PL45 260 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 MKXQ8IYA7 352 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 STARD4Q96DR4 205 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 RNF126Q9BV68 326 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 RAB18Q9NP72 206 aa9.67□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 A0A1B0GWJ7 208 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CCSO14618 274 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ARPC5O15511 151 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 TSC22D2O75157 780 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 B3GALNT1O75752 331 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 IFNA7P01567 189 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 GLAP06280 429 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 RAC2P15153 192 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 PI3P19957 117 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 PTGER4P35408 488 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ERVK11-1P61568 191 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 GNG3P63215 75 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 PDCD1Q15116 288 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR2T2Q6IF00 324 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 WDR86Q86TI4 376 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 LINC00596Q86U02 117 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 OR5M9Q8NGP3 310 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 DYRK2Q92630 601 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SLAMF9Q96A28 289 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 SEC22AQ96IW7 307 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 NMES1Q9C002 83 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 RHOFQ9HBH0 211 aa9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 RNF222A6NCQ9 220 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 K7EM74 188 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 LYZL6O75951 148 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CRHP06850 196 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 VAMP1P23763 118 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 UCP2P55851 309 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 BAMBIQ13145 260 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZNF345Q14585 488 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 C11orf88Q6PI97 169 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 ZNF573Q86YE8 665 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 GSX2Q9BZM3 304 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 Q9N2K0 584 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PGA3-201ENST00000325558 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 LEUTXA8MZ59 168 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 H0YIZ8 118 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TUBG1P23258 451 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SERPINF1P36955 418 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 KCNJ3P48549 501 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 PPP1CBP62140 327 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 IL13RA2Q14627 380 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 Q6P435 159 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 EXTL1Q92935 676 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 GALNT14Q96FL9 552 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 MFFQ9GZY8 342 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 PLK3Q9H4B4 646 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.65□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 A0A0D9SG52 128 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 FAM221AA4D161 298 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 POM121CA8CG34 1229 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 OR2F2O95006 317 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 CA6P23280 308 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 IL32P24001 234 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms