RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 LPAR6P43657 344 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 SLC6A9P48067 706 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 SCAND1P57086 179 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 BTNL8Q6UX41 500 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 CDC20BQ86Y33 519 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 APH1AQ96BI3 265 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ZFPL1O95159 310 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 RAB3DO95716 219 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 CRHP06850 196 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 DAOP14920 347 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ZBTB25P24278 435 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 PSMB6P28072 239 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 CEACAM6P40199 344 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ADAM8P78325 824 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 GAMTQ14353 236 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 PCK2Q16822 640 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 BIVMQ86UB2 503 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 OTOSQ8NHW6 89 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 GPX8Q8TED1 209 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 RNF126Q9BV68 326 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 UPK3AO75631 287 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ZNF735P0CB33 412 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ALOX5APP20292 161 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 EFNB2P52799 333 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 TAS2R19P59542 299 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 CD81P60033 236 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 LYG2Q86SG7 212 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 CD163Q86VB7 1156 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 GPR35Q9HC97 309 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 TSTD3H0UI37 97 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 M0QYG6 137 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 AGPAT2O15120 278 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ZNHIT1O43257 154 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 GPANK1O95872 356 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ARG1P05089 322 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 TACSTD2P09758 323 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 MSR1P21757 451 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 TIMP3P35625 211 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 OR3A2P47893 321 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ACTBP60709 375 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ACTG1P63261 375 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 EGR3Q06889 387 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 GUSBP1Q15486 140 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 NRN1LQ496H8 165 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 MITD1Q8WV92 249 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 DCUN1D4Q92564 292 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 YPEL4Q96NS1 127 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 NELFAQ9H3P2 528 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 CRLF2Q9HC73 371 aa8.84□□□□□ -0.99
GINS3-201ENST00000318129 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms