RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296130.4

CLEC3B-201, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC3B, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-201ENST00000296130 ZNF714Q96N38 554 aa23.46■■□□□ 1.35
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CLEC3B-201ENST00000296130 IGHV1-8P0DP01 117 aa23.45■■□□□ 1.34
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CLEC3B-201ENST00000296130 SYS1Q8N2H4 156 aa23.42■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 ZNF676Q8N7Q3 588 aa23.42■■□□□ 1.34
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CLEC3B-201ENST00000296130 HMG20AQ9NP66 347 aa23.42■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 ABCB10Q9NRK6 738 aa23.42■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 INPP5EQ9NRR6 644 aa23.42■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 PITPNC1Q9UKF7 332 aa23.42■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa23.42■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 OR4C45A6NMZ5 311 aa23.41■■□□□ 1.34
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CLEC3B-201ENST00000296130 OR52N4Q8NGI2 321 aa23.41■■□□□ 1.34
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CLEC3B-201ENST00000296130 IGHA1P01876 353 aa23.4■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 MINOS1Q5TGZ0 78 aa23.4■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 SAXO1Q8IYX7 474 aa23.4■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 RPS4Y2Q8TD47 263 aa23.4■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa23.4■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 ALG8Q9BVK2 526 aa23.4■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 SESN1Q9Y6P5 492 aa23.4■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa23.4■■□□□ 1.34
CLEC3B-201ENST00000296130 H3BUI4 141 aa23.39■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 PSPNO60542 156 aa23.39■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 DBTP11182 482 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 PAX6P26367 422 aa23.39■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 DUSP1P28562 367 aa23.39■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 DYNLT3P51808 116 aa23.39■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 RAB40BQ12829 278 aa23.39■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
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CLEC3B-201ENST00000296130 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 LHFPL3Q86UP9 236 aa23.39■■□□□ 1.33
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CLEC3B-201ENST00000296130 CHST6Q9GZX3 395 aa23.39■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa23.39■■□□□ 1.33
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CLEC3B-201ENST00000296130 SERPINA12Q8IW75 414 aa23.38■■□□□ 1.33
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CLEC3B-201ENST00000296130 TCF19Q9Y242 345 aa23.38■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 TMEM212A6NML5 194 aa23.37■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 CSF1P09603 554 aa23.37■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 LMO1P25800 156 aa23.37■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 P2RX3P56373 397 aa23.37■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 DYNAPQ8N1N2 210 aa23.37■■□□□ 1.33
CLEC3B-201ENST00000296130 S100A14Q9HCY8 104 aa23.37■■□□□ 1.33
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