RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 UCN2Q96RP3 112 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 LHFPL6Q9Y693 200 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0A6YYD4 124 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PPC4 97 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 FGF16O43320 207 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 NRASP01111 189 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MCEMP1Q8IX19 187 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 LFNGQ8NES3 379 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TVP23CQ96ET8 276 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 FAM210BQ96KR6 192 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 BCO1Q9HAY6 547 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 CACFD1Q9UGQ2 172 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 BTBD17A6NE02 478 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 CLDN1O95832 211 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SLC35G3Q8N808 338 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 POU2F2P09086 479 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 DYNLT3P51808 116 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF787Q6DD87 383 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 CALHM2Q9HA72 323 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 GPR179Q6PRD1 2367 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 C5orf63A6NC05 138 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 LIPT2A6NK58 231 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM14DPA8MWL7 114 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TERTO14746 1132 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 AADACP22760 399 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 OTX2P32243 289 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ERVS71-1P61550 626 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 RAB1AP62820 205 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SHHQ15465 462 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 AAED1Q7RTV5 226 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 IL22RA1Q8N6P7 574 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MOB1AQ9H8S9 216 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ANKUB1A6NFN9 424 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 DHHO43323 396 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 DEDDO75618 318 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TUSC2O75896 110 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 METTL15P1P0C7V9 234 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 FAM157CP0CG43 387 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SNCAP37840 140 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 EIF1P41567 113 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ARF1P84077 181 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SHBQ15464 509 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 VAX1Q5SQQ9 334 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF600Q6ZNG1 722 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 OR5AS1Q8N127 324 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TUBG2Q9NRH3 451 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 OR14J1Q9UGF5 321 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MMP17Q9ULZ9 603 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ADIPOR1Q96A54 375 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 KCNK17Q96T54 332 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 GABRG3Q99928 467 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SMIM7Q9BQ49 75 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 HINT2Q9BX68 163 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 UBE2V2Q15819 145 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 GFI1BQ5VTD9 330 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 FDX2Q6P4F2 183 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 C5orf24Q7Z6I8 188 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 LHX4Q969G2 390 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 MASP2O00187 686 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 TNFSF11O14788 317 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 DHRS3O75911 302 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 IFNA1P01562 189 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV4-34P06331 123 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 HAAOP46952 286 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 DMWDQ09019 674 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 GAMTQ14353 236 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF66Q6ZN08 573 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 OSR2Q8N2R0 312 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 OXGR1Q96P68 337 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 CD200P41217 278 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PLPPR2Q96GM1 343 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 COL4A3Q01955 1670 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-201ENST00000295718 H7BYZ3 331 aa12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms