RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CYR61O00622 381 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 BGLAPP02818 100 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CT45A8P0DMV1 189 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CT45A9P0DMV2 189 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 IL12BP29460 328 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 VSTM2LQ96N03 204 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 WWTR1Q9GZV5 400 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 NAGKQ9UJ70 344 aa8.94□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 HSPB2A8KAH6 182 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 MSTNO14793 375 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 FCGR2AP12318 317 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 BMP5P22003 454 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 HOXA6P31267 233 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 HERV-K104P61576 105 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 GNB2P62879 340 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 NOGQ13253 232 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 IL15RAQ13261 267 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 HSPB2Q16082 182 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 PRR18Q8N4B5 295 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ANGPTL7O43827 346 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 WISP1O95388 367 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 UTS2O95399 124 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 DDAH2O95865 285 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 IL11P20809 199 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 MAS1LP35410 378 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 PPP1CAP62136 330 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF141Q15928 474 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CALHM1Q8IU99 346 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF695Q8IW36 515 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CEP290O15078 2479 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 PLXNA2O75051 1894 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 A0A1W2PQU0 124 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 IFNA5P01569 189 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CEACAM5P06731 702 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CHRNA7P36544 502 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ROM1Q03395 351 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF92Q03936 586 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 FDX2Q6P4F2 183 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 SYT3Q9BQG1 590 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 VPS25Q9BRG1 176 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.93□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 IGSF23A1L1A6 192 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 F5H5K5 113 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 H0Y8X5 98 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 HCRTR1O43613 425 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 HBE1P02100 147 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CDAP32320 146 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 DCAF10Q5QP82 559 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 THEM4Q5T1C6 240 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 SFTPA2Q8IWL1 248 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 RSG1Q9BU20 258 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 S1PR5Q9H228 398 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 PLK3Q9H4B4 646 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF117Q03924 483 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 FAM189A2Q15884 450 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 UEVLDQ8IX04 471 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.92□□□□□ -0.98
CLDN1-201ENST00000295522 NAA60Q9H7X0 242 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms