RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 CDK5Q00535 292 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2Y1Q8NGV0 311 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CDCA4Q9BXL8 241 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 MCM3APO60318 1980 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 EPOPA6NHQ4 379 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 FGF2P09038 288 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 EMP1P54849 157 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CD276Q5ZPR3 534 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 BTF3L4Q96K17 158 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SOSTQ9BQB4 213 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 TUBA4BQ9H853 241 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC6A13Q9NSD5 602 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM200CA6NKL6 621 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PLPP3O14495 311 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5AL1P0C617 328 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SP9P0CG40 484 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 DHODHQ02127 395 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 NHLH1Q02575 133 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 NHLH2Q02577 135 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 NCR3LG1Q68D85 454 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CACNA1CQ13936 2221 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PN81 502 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 VDAC1P21796 283 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CHRNA7P36544 502 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PAFAH1B2P68402 229 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 OTOSQ8NHW6 89 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 THYN1Q9P016 225 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 IFITM5A6NNB3 132 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 ETV6P41212 452 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 ROM1Q03395 351 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CDK5R1Q15078 307 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 E5RGE8 158 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PRR35P0CG20 571 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 ACVR1Q04771 509 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4C16Q8NGL9 310 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SNX22Q96L94 193 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL30P62888 115 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 DEFA6Q01524 100 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 COL10A1Q03692 680 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 FUT7Q11130 342 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 NTN4Q9HB63 628 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV3-23P01764 117 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CPN1P15169 458 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PSMB2P49721 201 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SIRT7Q9NRC8 400 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF7Q9UBF6 113 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PCM1Q15154 2024 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SMPD2O60906 423 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PSMB6P28072 239 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 FADS6Q8N9I5 356 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4B1Q8NGF8 309 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 DHRS3O75911 302 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 HTR1DP28221 377 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 ISXQ2M1V0 245 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 VWA1Q6PCB0 445 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM26EQ8N5C1 309 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2J1Q9GZK6 312 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SELENOKQ9Y6D0 94 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.48□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 LY6DQ14210 128 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 PIGYQ3MUY2 71 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 COMMD1Q8N668 190 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 OR8B12Q8NGG6 310 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 TRPM6Q9BX84 2022 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 FBP1P09467 338 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 FPR2P25090 351 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SULT1A1P50225 295 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD55Q3KP44 614 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 NHLRC2Q8NBF2 726 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 HMX2A2RU54 273 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV3-25P01717 112 aa10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
UBASH3B-201ENST00000284273 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms