RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.52□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 LRFN1Q9P244 771 aa9.52□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.52□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 UTS2O95399 124 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PTGER4P35408 488 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 EMC4Q5J8M3 183 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TEX30Q5JUR7 227 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 NT5CQ8TCD5 201 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 STT3BQ8TCJ2 826 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CLDN23Q96B33 292 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SOX7Q9BT81 388 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 LANCL2Q9NS86 450 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TLCD2A6NGC4 264 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 E5RGE8 158 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CST7O76096 145 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 BPNT1O95861 308 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 DANCRP0C864 163 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 FGF7P21781 194 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 IL2RGP31785 369 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PIGPP57054 158 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 VAMP2P63027 116 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SRYQ05066 204 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 MUCL1Q96DR8 90 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 NSG2Q9Y328 171 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.52□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 A8MVM7 634 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 H3BML4 177 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 RAD51DO75771 328 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SCGNO76038 276 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 MMP9P14780 707 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CCL11P51671 97 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf100Q5SVJ3 147 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf87Q8N0U7 546 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 COMMD1Q8N668 190 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 OR10A2Q9H208 303 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PLEKHA2Q9HB19 425 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 GNG13Q9P2W3 67 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF292O60281 2723 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 A6NIZ1 184 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 H0YIG0 161 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ONECUT2O95948 504 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 APLNRP35414 380 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PCP4P48539 62 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TAS2R46P59540 309 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 RAP1BP61224 184 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf140Q5VVS0 124 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TVP23CQ96ET8 276 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 IL17BQ9UHF5 180 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PADI1Q9ULC6 663 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CADP27708 2225 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 FAM157AC9JC47 383 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 HSPA12AO43301 675 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 DEDDO75618 318 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.51□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SCGB1D1O95968 90 aa9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SLC26A5P58743 744 aa9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 RND3P61587 244 aa9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 CFHR1Q03591 330 aa9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 ELOBQ15370 118 aa9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 GPR157Q5UAW9 335 aa9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.5□□□□□ -0.89
CNGA3-201ENST00000272602 SLC22A25Q6T423 547 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms