RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 BDKRB2P30411 391 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 GABARAPL2P60520 117 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ACSM3Q53FZ2 586 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 LIPKQ5VXJ0 399 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 MS4A15Q8N5U1 240 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 Q8NFD4 153 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 PXT1Q8NFP0 134 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 WDFY2Q96P53 400 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 BLOC1S6Q9UL45 172 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 FOXJ3Q9UPW0 622 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 IFNA2P01563 188 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 CHRM2P08172 466 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 PRKACAP17612 351 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 EPHA1P21709 976 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 C17orf107Q6ZR85 190 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 SATL1Q86VE3 508 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 Q8N7P7 452 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TMED9Q9BVK6 235 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 RHOFQ9HBH0 211 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ACOT13Q9NPJ3 140 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 C19orf12Q9NSK7 152 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ZNF69Q9UC07 566 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 NUP50Q9UKX7 468 aa18.35■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 DSCAML1Q8TD84 2053 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB3O15480 346 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 HAND1O96004 215 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 CPEP16870 476 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 PTGFRP43088 359 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 OR3A4PP47883 348 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 PPP3R1P63098 170 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ARMCX4Q5H9R4 360 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 FAM27D1Q5T7N8 215 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 DDI2Q5TDH0 399 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ELP2Q6IA86 826 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TMEM91Q6ZNR0 172 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 UFD1Q92890 307 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 MGLLQ99685 303 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 FAM234AQ9H0X4 552 aa18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 PSPNO60542 156 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TOX4O94842 621 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 HSMCR30P0CW71 290 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 SNU13P55769 128 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 SPIN3Q5JUX0 258 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 Q6P435 159 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 PHC2Q8IXK0 858 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 C22orf15Q8WYQ4 148 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 PCGF1Q9BSM1 259 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 KPTNQ9Y664 436 aa18.33■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 LMO1P25800 156 aa18.32■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 CAPZA1P52907 286 aa18.32■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 RPS25P62851 125 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SPARTQ8N0X7 666 aa18.32■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 C11orf42Q8N5U0 333 aa18.32■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 TMEM203Q969S6 136 aa18.32■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SNX22Q96L94 193 aa18.32■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 GPER1Q99527 375 aa18.32■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 TRAV40A0A0B4J280 105 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 CDRT1O95170 752 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 MAS1P04201 325 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 DLX1P56177 255 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SSX1Q16384 188 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 METTL11BQ5VVY1 283 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 TMEM200BQ69YZ2 307 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 ZNF367Q7RTV3 350 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 KIR3DL3Q8N743 410 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OR4S1Q8NGB4 309 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OR4M1Q8NGD0 313 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OR51T1Q8NGJ9 327 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OR10K1Q8NGX5 313 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF14Q92956 283 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 CKLFQ9UBR5 152 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 LRRC42Q9Y546 428 aa18.31■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OR2H2O95918 312 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 UCHL1P09936 223 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 CD37P11049 281 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 MTNR1BP49286 362 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 PDCD1Q15116 288 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 C9orf139Q6ZV77 190 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms