RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZNF737O75373 536 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR3A4PP47883 348 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 LGALS7P47929 136 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 KLK11Q9UBX7 282 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PSG11Q9UQ72 335 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 CLDN34H7C241 214 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 NAT2P11245 290 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HLA-GP17693 338 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SLC6A1P30531 599 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 CD96P40200 585 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GNG10P50151 68 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HERVK_113P61574 105 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SKP2Q13309 424 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FAM209AQ5JX71 171 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZS52 159 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 LYG1Q8N1E2 194 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.4□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 M0R296 226 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 NGFRP08138 427 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ACP1P24666 158 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 KRTDAPP60985 99 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GGTLC2Q14390 218 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 NKG7Q16617 165 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PRR27Q6MZM9 219 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 STPG2Q8N412 459 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 BLNKQ8WV28 456 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PTX4Q96A99 478 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PPQ1 181 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PDE6DO43924 150 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 CTSVO60911 334 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HAND1O96004 215 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR4A8P0C604 315 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HES3Q5TGS1 186 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PDPNQ86YL7 162 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GNRHR2Q96P88 292 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 RNF7Q9UBF6 113 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SMIM6P0DI80 62 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PI3P19957 117 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PMP22Q01453 160 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SSX1Q16384 188 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 WBP1LQ9NX94 342 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 IGSF23A1L1A6 192 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PHOX2AO14813 284 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HSBP1O75506 76 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ONECUT2O95948 504 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 WNT1P04628 370 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SPNP16150 400 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 COL9A1P20849 921 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZP4Q12836 540 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 XAF1Q6GPH4 301 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 VASH2Q86V25 355 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR2C3Q8N628 320 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 R3HDM4Q96D70 268 aa6.39□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 LOXL4Q96JB6 756 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms