RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm17669F6QL70 154 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nkx2-1P50220 372 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1443Q8VFW8 312 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr472Q8VG43 310 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr56Q8VGD6 315 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Erv3Q9DAX3 200 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spint2Q9WU03 252 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd101A8E0Y8 1033 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r129E9QA94 307 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm8720K9J7F4 307 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 GrprP21729 384 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nxph1Q61200 271 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ubqln3Q8C5U9 658 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nsun3Q8CCT7 348 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1394Q8VET2 312 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 BambiQ9D0L6 260 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hacd1Q9QY80 281 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc37a2Q9WU81 501 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Myo10F8VQB6 2062 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr573-ps1A0A1B0GRU2 297 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ankrd29D3YVV3 309 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01675 107 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01676 107 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01677 107 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01678 107 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bpifa2P07743 235 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NrasP08556 189 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd79aP11911 220 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klk1b26P36369 261 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Abcd3P55096 659 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PkibQ04758 92 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MybphlQ5FW53 355 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Taar8bQ5QD06 344 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tfap2eQ6VUP9 442 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Txnl1Q8CDN6 289 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dmbx1Q91ZK4 381 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr887Q9EQA6 309 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Smco4Q9JIS3 59 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mecp2Q9Z2D6 484 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Muc3E9PWP7 378 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Timm8bP62077 83 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 6430531B16RikQ3V2J1 307 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyb561Q60720 250 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1212Q7TR08 311 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1031Q7TR87 336 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr222Q7TS30 318 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ddb2Q99J79 432 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cxcl15Q9WVL7 167 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mtnd4lP03903 98 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fosl2P47930 326 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm826Q3UQ74 109 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptp4a1Q63739 173 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr907Q7TRC7 310 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Znf574Q8BY46 900 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc24a5Q8C261 501 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1151Q8VFQ8 308 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmprss11dQ8VHK8 417 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TrilQ9DBY4 809 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4930563M21RikA0A1L1SUT5 578 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r80L7N1Z3 308 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1286Q7TQY2 305 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr374Q7TRY0 313 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem108Q8BHE4 574 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gtdc1Q8BW56 445 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ldlrad4Q8BWJ4 306 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vopp1Q8R1C3 172 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 GhsrQ99P50 364 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Srxn1Q9D975 136 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Il36aQ9JLA2 160 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tagln2Q9WVA4 199 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cx3cr1Q9Z0D9 354 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm5901D3YVJ1 333 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm21721J3QMK7 227 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr628K7N6B2 316 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Chek1O35280 476 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klf16P58334 251 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Osgin2Q3TEE9 550 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 BC100530Q497J0 97 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P4htmQ8BG58 503 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Flrt3Q8BGT1 649 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8BN57 294 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Seh1lQ8R2U0 360 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 9930021J03RikH3BKP8 2027 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wsb1O54927 421 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 EnamO55196 1274 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccr2P51683 373 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ucp3P56501 308 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CycsP62897 105 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ear2P97425 156 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ndufb6Q3UIU2 128 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Scarb1Q61009 509 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc38a2Q8CFE6 504 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r59Q8R2B9 310 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PinlypQ9CQD7 212 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem186Q9CR76 216 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PigcQ9CXR4 297 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ShpkQ9D5J6 476 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psme4Q5SSW2 1843 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr243E9PV96 316 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 97.3 ms