RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 DLGAP1O14490 977 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF737O75373 536 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV3-1P01715 115 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MPZP25189 248 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGDIBP52566 201 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 RIDAP52758 137 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf89Q6UX73 402 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GIPC3Q8TF64 312 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 YIPF3Q9GZM5 350 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGIXQ9H6Y5 334 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTR3BQ9P1U1 418 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGN1P05114 100 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK11-1P61568 191 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 APOFQ13790 326 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX22Q96L94 193 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM107BQ9H098 131 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00312Q9Y6C7 94 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 U3KQK5 164 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF254O75437 659 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TTRP02766 147 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRR1P24046 479 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 IL24Q13007 206 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GRK1Q15835 563 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF679Q8IYX0 411 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4P4Q8NGL7 312 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP19Q96LK0 163 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PKIBQ9C010 78 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST6Q9GZX3 395 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 DPM3Q9P2X0 92 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2F2O95006 317 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL2L15Q5TBC7 163 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM42Q69YG0 159 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ETV3LQ6ZN32 361 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SLAMF9Q96A28 289 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 NDE1Q9NXR1 346 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A11Q9UPY5 501 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRBV5S2A0A599 114 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM82A0PJX8 343 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMB11A5LHX3 300 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT19A8MXV4 375 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR32B1ATL7 298 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 LMO1P25800 156 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX2P28328 305 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATS1Q496A3 300 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SLX4IPQ5VYV7 408 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 OSR2Q8N2R0 312 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB17Q8WXJ9 295 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TAGLN3Q9UI15 199 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 V9GYS6 101 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 F8VVB4 439 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 F8VWA3 439 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A5P22732 501 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ROM1Q03395 351 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD12Q8N2K0 398 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TFAP2CQ92754 450 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX12Q9BXU0 123 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MOB1AQ9H8S9 216 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 COPS3Q9UNS2 423 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP23AO75900 390 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HAND1O96004 215 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 THBS3P49746 956 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 DGCR2P98153 550 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAPC1Q16533 368 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF329Q86UD4 541 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 EGFL6Q8IUX8 553 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 OR14K1Q8NGZ2 314 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF596Q8TC21 504 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHA1Q9HB21 404 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MTCH1Q9NZJ7 389 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB9Q9UBS3 223 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM172BPA6NC97 362 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHA1P01876 353 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 DHFR2Q86XF0 187 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF556Q9HAH1 456 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52A1Q9UKL2 312 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 LEUTXA8MZ59 168 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CST1P01037 141 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52W1Q6IF63 320 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf86Q6ZUL3 223 aa21.74■■□□□ 1.07
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