RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NKPD1Q17RQ9 610 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 GDPD3Q7L5L3 318 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-215ENST00000628018 ELMOD3Q96FG2 381 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 PECRQ9BY49 303 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCE1Q9P212 2302 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A18PA6NE21 464 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A16PA6NEW6 464 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A7PA6NKC0 464 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A22PA8MWA6 464 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A12PA8MX19 464 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A15PP0C7V4 464 aa21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00596Q86U02 117 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-215ENST00000628018 NEDD4LQ96PU5 975 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-215ENST00000628018 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-215ENST00000628018 HES4Q9HCC6 221 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-215ENST00000628018 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-215ENST00000628018 IL19Q9UHD0 177 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf80F5H4A9 247 aa21.04■□□□□ 0.96
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