RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 FAM168AQ92567 244 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SEH1LQ96EE3 360 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TIMD4Q96H15 378 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.15□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 KCNK15Q9H427 330 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.15□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 USF3Q68DE3 2245 aa7.15□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 VSIG8P0DPA2 414 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 Q5PR19 223 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ASCL4Q6XD76 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 GHRLQ9UBU3 117 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 TFF1P04155 84 aa7.13□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 CAPZA1P52907 286 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ART1P52961 327 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 DSCR9P59020 149 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 FGF12P61328 243 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 UNC119Q13432 240 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 PIGYQ3MUY2 71 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF404Q494X3 552 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ELP2Q6IA86 826 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 OR10K2Q6IF99 312 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM104Q8NE00 496 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.13□□□□□ -1.27
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