RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 NEUROG1Q92886 237 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2V2Q96R30 315 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 HSF4Q9ULV5 492 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NLC8 198 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 SOCS1O15524 211 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFA1P59665 94 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFA3P59666 94 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM209AQ5JX71 171 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM58AQ8N1B3 248 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 POC1AQ8NBT0 407 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf18Q8NEA5 215 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 SETD6Q8TBK2 473 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 YIPF5Q969M3 257 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 NRIP2Q9BQI9 281 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNA1DQ01668 2161 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 INPP1P49441 399 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM50BP56557 158 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 IL13RA2Q14627 380 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 MPV17LQ2QL34 196 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZTK2 550 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM63Q969Q1 353 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 FN3KRPQ9HA64 309 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 DYSFO75923 2080 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 DGCR2P98153 550 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 CDNFQ49AH0 187 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR82Q6UXN9 313 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 TANC2Q9HCD6 1990 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PQ09 198 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF1AP19438 455 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRR1P24046 479 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 TESK1Q15569 626 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF9Q16594 264 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 MUC15Q8N387 334 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXW5Q969U6 566 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 FAIMQ9NVQ4 179 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PKDREJQ9NTG1 2253 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINE3A8MV23 424 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 MFNGO00587 321 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 CA11O75493 328 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 MPPED2Q15777 294 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SWI5Q1ZZU3 235 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PCGF3Q3KNV8 242 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGYQ3MUY2 71 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PLAC9Q5JTB6 97 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52I2Q8NH67 350 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ITLN1Q8WWA0 313 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 HES4Q9HCC6 221 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNLRB1Q9NP97 96 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 F8VVB4 439 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 F8VWA3 439 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 LPLP06858 475 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKACAP17612 351 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 MST1LQ2TV78 715 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 GPX8Q8TED1 209 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 NEDD4LQ96PU5 975 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 EGLN1Q9GZT9 426 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 UFSP2Q9NUQ7 469 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 RASL12Q9NYN1 266 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 H7C417 338 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 NXPH2O95156 264 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PMELP40967 661 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS21Q2M5E4 152 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SPIN3Q5JUX0 258 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 DEDD2Q8WXF8 326 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SPOCK3Q9BQ16 436 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PECRQ9BY49 303 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT22Q9H7X7 185 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SPACA1Q9HBV2 294 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf123Q9NWV4 160 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R8Q9NYW2 309 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 MTFP1Q9UDX5 166 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO18BQ8IUG5 2567 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM235A6NFC5 223 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCD6O75340 191 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 RBBP9O75884 186 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ECDO95905 644 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 CD3GP09693 182 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 GNB3P16520 340 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 CHATP28329 748 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTBP60709 375 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTG1P63261 375 aa26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms