RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 C9J4A7 227 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 EREGO14944 169 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ADAP1O75689 374 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 MT-ND4LP03901 98 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 FCGR2AP12318 317 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 MSX1P28360 303 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SPINK14Q6IE38 97 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 OR51T1Q8NGJ9 327 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 OR4K15Q8NH41 348 aa13.17□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 R4GN57 208 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 C5orf51A6NDU8 294 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PHOX2AO14813 284 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 CXCL13O43927 109 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RPA2P15927 270 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PKIAP61925 76 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ARL11Q969Q4 196 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 ULBP2Q9BZM5 246 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PIGLQ9Y2B2 252 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.16□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 NPSP0C0P6 89 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 LIFP15018 202 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RAB5AP20339 215 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PAX6P26367 422 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ZNF774Q6NX45 483 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 DEGS2Q6QHC5 323 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 DEFB123Q8N688 67 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 FADS6Q8N9I5 356 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 CDC14BO60729 498 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 CCL2P13500 99 aa13.16□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 SNU13P55769 128 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SLC35A1P78382 337 aa13.16□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 HGFACQ04756 655 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 KISS1Q15726 138 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 MPPED2Q15777 294 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.16□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 C6orf201Q7Z4U5 140 aa13.16□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 CCDC187A0A096LP49 1063 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PINLYPA6NC86 204 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SNAPC5O75971 98 aa13.16□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 KNG1P01042 644 aa13.16□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 EGLN1Q9GZT9 426 aa13.16□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 ABHD3Q8WU67 409 aa13.15□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 FOLR3P41439 243 aa13.15□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 SLC25A53Q5H9E4 307 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 OR2Y1Q8NGV0 311 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RNF138Q8WVD3 245 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 THRSPQ92748 146 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TMEM14DPA8MWL7 114 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 CELA3AP09093 270 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 MSR1P21757 451 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 GLRA1P23415 457 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 MECP2P51608 486 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.14□□□□□ -0.31
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