RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf68Q2NKX9 166 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 LY6G6FQ5SQ64 297 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF585AQ6P3V2 769 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 PLXDC2Q6UX71 529 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 DPPA2Q7Z7J5 298 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 MRGPRFQ96AM1 343 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 PHB2Q99623 299 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRR3Q9UBC9 169 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 TACC2O95359 2948 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 C9orf170A2RU37 121 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 FIGNL2A6NMB9 653 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A4P12235 298 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP3CBP16298 524 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP10-9P60411 292 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB14P61106 215 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 ARFRP1Q13795 201 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8B8Q15620 311 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 NKPD1Q17RQ9 610 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 ESCO2Q56NI9 601 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52W1Q6IF63 320 aa21.95■■□□□ 1.11
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CAPNS1-204ENST00000587718 COLCA1Q6ZS62 124 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 PXT1Q8NFP0 134 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 SARAFQ96BY9 339 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 PECRQ9BY49 303 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 EDARQ9UNE0 448 aa21.95■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 NKX2-6A6NCS4 301 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 GLI4P10075 376 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 CALCRP30988 508 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 SKA3Q8IX90 412 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5H2Q8NGV7 314 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD3Q8WU67 409 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 Q96M66 194 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 LDAHQ9H6V9 325 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 GP6Q9HCN6 339 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR1O75083 606 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 FPR2P25090 351 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 MICBQ29980 383 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf183Q5T699 404 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-204ENST00000587718 LHFPL1Q86WI0 220 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 GSX2Q9BZM3 304 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ16Q9NPI9 418 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF25Q9UIL4 384 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR132Q9UNW8 380 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2AT4A6NND4 320 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM90A27PA6NNH2 459 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-204ENST00000587718 PMELP40967 661 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 OR3A3P47888 321 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 RBP2P50120 134 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 FUT6P51993 359 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 MTCP1P56278 107 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPO2Q5TGU0 170 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF12L2Q5VW00 463 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QL2Q7Z5L3 287 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0D9SG52 128 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF587BE7ETH6 402 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD51DO75771 328 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 AMY2BP19961 511 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM128Q5BJH2 165 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 TMUB2Q71RG4 321 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8H3Q8N146 312 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 AKR7LQ8NHP1 331 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC7A11Q9UPY5 501 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 MED12Q93074 2177 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0G2JNJ9 132 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PP11 408 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 RP2O75695 350 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 SIX6O95475 246 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 PMP2P02689 132 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP1B3P54709 279 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 IL13RA1P78552 427 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 HGFACQ04756 655 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R1AQ13522 171 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF345Q14585 488 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 SFRP5Q5T4F7 317 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ANGPTL6Q8NI99 470 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 BORCS8Q96FH0 119 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A15Q9H2J7 730 aa21.91■■□□□ 1.1
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