RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYYR1Q96J86 154 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PKIBQ9C010 78 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 VSIG10L2P0DP72 767 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 MICBQ29980 383 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIGYQ3MUY2 71 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 GFRALQ6UXV0 394 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 C3P1Q6ZMU1 363 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 DMRTB1Q96MA1 342 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIGMQ9H3S5 423 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 POU2F3Q9UKI9 436 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPBWR2P48146 333 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM76BQ5HYJ3 339 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARRDC1Q8N5I2 433 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10AD1Q8NGE0 317 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCL2L14Q9BZR8 327 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CA6P23280 308 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGF12P61328 243 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ERVS71-1P61550 626 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 NKPD1Q17RQ9 610 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC120Q96HB5 630 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEC22CQ9BRL7 303 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51I2Q9H344 312 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 MTCH1Q9NZJ7 389 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 A8MXE2 369 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 SSNA1O43805 119 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDCD6O75340 191 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 RLN1P04808 185 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAS2R46P59540 309 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL24Q13007 206 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSG7Q13046 419 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 NKAPLQ5M9Q1 402 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 NOXA1Q86UR1 476 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF843Q8N446 348 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZDHHC22Q8N966 263 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 RHOFQ9HBH0 211 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM82A0PJX8 343 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 B8ZZF3 427 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1QBP02746 253 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFNA6P05013 189 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCL3P20749 454 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 DTYMKP23919 212 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNJ8Q15842 424 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPICQ8N5J4 248 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC107Q8WV48 283 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLAMF9Q96A28 289 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRGPRFQ96AM1 343 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAAP24Q9BTP7 215 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 RTL8AQ9BWD3 113 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 EDARQ9UNE0 448 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPTNQ9Y639 398 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 COL6A6A6NMZ7 2263 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEIKINA0A087WXM9 373 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PMP2P02689 132 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 FUT3P21217 361 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNU13P55769 128 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 S100PBPQ96BU1 408 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 MICU1Q9BPX6 476 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 SULT4A1Q9BR01 284 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHST6Q9GZX3 395 aa24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CEACAM18A8MTB9 384 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAPPC2LH3BP13 241 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANXA3P12429 323 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CXCL3P19876 107 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 AMY2BP19961 511 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRGPRGQ86SM5 289 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLK3Q9H4B4 646 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF581Q9P0T4 197 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 AK3Q9UIJ7 227 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1QL1O75973 258 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 KITLGP21583 273 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5H2Q8NGV7 314 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM208BQ5VWN6 2430 aa24.27■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHD6Q8TD26 2715 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A0G2JNJ9 132 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 J3QT63 122 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSN2P05814 226 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 MPV17P39210 176 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC00596Q86U02 117 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5AP2Q8NGF4 316 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q9UFV3 132 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRP5LA4QPB2 252 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 H3BUI4 141 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYNGR1O43759 233 aa24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms