RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572205.5

SMG6-210, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 4

Gene SMG6, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-210ENST00000572205 SLC34A1Q06495 639 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KCNJ8Q15842 424 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TTC23Q5W5X9 447 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 LYPD6Q86Y78 171 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 OR52N1Q8NH53 320 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 NANPQ8TBE9 248 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 PP6455Q8WZ26 134 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 Q96MT0 163 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 WDFY2Q96P53 400 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 NUP50Q9UKX7 468 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 HHLA2Q9UM44 414 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 A0A0A6YYJ9 748 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TMEM82A0PJX8 343 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ERICH4A6NGS2 130 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TMEM212A6NML5 194 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 H0YJX3 145 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ALX3O95076 343 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 IFNA2P01563 188 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ATF1P18846 271 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 DCKP27707 260 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ATP6V1E1P36543 226 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 IL13RA1P78552 427 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 IKZF1Q13422 519 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 IRF3Q14653 427 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ZNF573Q86YE8 665 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RNF141Q8WVD5 230 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ST8SIA4Q92187 359 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 FGGYQ96C11 551 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SMIM19Q96E16 107 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 CYYR1Q96J86 154 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SPACA5Q96QH8 159 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 MRI1Q9BV20 369 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RASL12Q9NYN1 266 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KPTNQ9Y664 436 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SNTNA6NMZ2 147 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RNF212BA8MTL3 300 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SLC1A7O00341 560 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 PSPNO60542 156 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KDM4BO94953 1096 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KNG1P01042 644 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 BCL3P20749 454 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 FUT6P51993 359 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SLC35A2P78381 396 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ST3GAL4Q11206 333 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KLRD1Q13241 179 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ZNF273Q14593 569 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 CCDC58Q4VC31 144 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KLHL22Q53GT1 634 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RNLSQ5VYX0 342 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.11□□□□□ -1.27
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