RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCGNO76038 276 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACTL6AO96019 429 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERPINA5P05154 406 aa8.76□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 CD34P28906 385 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 WNT5AP41221 380 aa8.76□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPSB1Q96BD6 273 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 C10orf35Q96D05 121 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 METTL9Q9H1A3 318 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 LIME1Q9H400 295 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 AK3Q9UIJ7 227 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.76□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 SSTP61278 116 aa8.75□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 TERB2Q8NHR7 220 aa8.75□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.75□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 EHFQ9NZC4 300 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 GHRLQ9UBU3 117 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RP2O75695 350 aa8.75□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 REG4Q9BYZ8 158 aa8.75□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ATP1B3P54709 279 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRDX4Q13162 271 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZMYND11Q15326 602 aa8.74□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF611Q8N823 705 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLAMF9Q96A28 289 aa8.74□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF75AQ96N20 296 aa8.74□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.74□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 XRCC2O43543 280 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 LYZL6O75951 148 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 NRN1LQ496H8 165 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF546Q86UE3 836 aa8.74□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF488Q96MN9 340 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIB1Q96RU8 372 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF122Q9H9V4 155 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPR132Q9UNW8 380 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.74□□□□□ -1.01
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