RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SLAMF9	Q96A28	289 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf36	Q96KX1	117 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200		J3QLW9	94 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR1A	P08908	422 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF19	P17023	458 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	RBP2	P50120	134 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	COL10A1	Q03692	680 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	MKX	Q8IYA7	352 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SYS1	Q8N2H4	156 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	APH1B	Q8WW43	257 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	FGGY	Q96C11	551 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	BEX1	Q9HBH7	125 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	AMBN	Q9NP70	447 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		17.76	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	DLX6	P56179	175 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF273	Q14593	569 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	MIDN	Q504T8	468 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf50	Q8WW18	174 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200		Q96MT0	163 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG8	Q9BVK2	526 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	HHLA2	Q9UM44	414 aa		17.75	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPH5	198 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRM2	P08172	466 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL3L1	P16619	93 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ATF1	P18846	271 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	NPBWR2	P48146	333 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB40B	Q12829	278 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		17.74	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ANGPTL7	O43827	346 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKACB	P22694	351 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP1B3	P54709	279 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	MTCP1	P56278	107 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVFRD-1	P60508	538 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8IYB0	196 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SPSB1	Q96BD6	273 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		17.73	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM82	A0PJX8	343 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf98	A8MV24	154 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	INMT	O95050	263 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	PAH	P00439	452 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	MT-ND2	P03891	347 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF20	P17024	532 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8H2	Q8N162	312 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01006	Q8NI28	216 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	RDH12	Q96NR8	316 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200		E9PI62	339 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL3	P20749	454 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF144B	Q7Z419	303 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5R1	Q8NH85	324 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX22	Q96L94	193 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	OPALIN	Q96PE5	141 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	17.72	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFPL1	O95159	310 aa		17.71	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	BAG2	O95816	211 aa		17.71	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	HAND1	O96004	215 aa		17.71	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	POU3F4	P49335	361 aa		17.71	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF146	Q15072	292 aa		17.71	■□□□□ 0.43

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