RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 PMP2P02689 132 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 THBDP07204 575 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF735P0CB33 412 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD40P25942 277 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHATP28329 748 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARL6IP1Q15041 203 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR10AD1Q8NGE0 317 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 GIMAP1Q8WWP7 306 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNAPC3Q92966 411 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC6A7Q99884 636 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RHBDL1O75783 438 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 HRH1P35367 487 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLRXP35754 106 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAG2P55895 527 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MSMPQ1L6U9 139 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ELP2Q6IA86 826 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q8NFD4 153 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 BEST4Q8NFU0 473 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 LILRB4Q8NHJ6 448 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DYRK2Q92630 601 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 AK3Q9UIJ7 227 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANAPC10Q9UM13 185 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CADP27708 2225 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MLNRO43193 412 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PEX14O75381 377 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTAFRP25105 342 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CBX5P45973 191 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FGF12P61328 243 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL24Q13007 206 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CBX3Q13185 183 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM108Q6UXF1 575 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 WFDC8Q8IUA0 241 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR4K15Q8NH41 348 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PKIBQ9C010 78 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MSL2Q9HCI7 577 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSF4Q9ULV5 492 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRP5LA4QPB2 252 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DISC1C4P0D8 188 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 J3QT63 122 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRPP07492 148 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRKACAP17612 351 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAT1P18440 290 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MEF2DQ14814 521 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATAD3CQ5T2N8 411 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 VHLLQ6RSH7 139 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZR03 302 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRP11Q86VZ4 500 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCCPDHQ8NBX0 429 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 GHITMQ9H3K2 345 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUSP13Q9UII6 198 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GUH1 482 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE2QL1A1L167 161 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 C7orf66A4D0T2 115 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDCD6O75340 191 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CA11O75493 328 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF250P15622 560 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 AMY2BP19961 511 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPZP25189 248 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUSP1P28562 367 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MICBQ29980 383 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOGA1Q86XE5 327 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR51J1Q9H342 316 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GWJ7 208 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A27PA6NNH2 459 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 F5H5P2 479 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RLN1P04808 185 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FUT3P21217 361 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF154Q13106 437 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST3GAL2Q16842 350 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR6F1Q8NGZ6 308 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms