RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52L1Q8NGH7 329 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52N4Q8NGI2 321 aa7□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 SNX22Q96L94 193 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 INTS14Q96SY0 518 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 MED20Q9H944 212 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 CDH10Q9Y6N8 788 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM172BPA6NC97 362 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 JTBO76095 146 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 SEMG1P04279 462 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 MPZP25189 248 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 UTF1Q5T230 341 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 TEX38Q6PEX7 206 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF573Q86YE8 665 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 DRAM1Q8N682 238 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF596Q8TC21 504 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 THEM6Q8WUY1 208 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 RCN3Q96D15 328 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 NIPAL2Q9H841 368 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0U1RQV5 110 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 CCRL2O00421 344 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 GSC2O15499 205 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 IGLV3-1P01715 115 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 GLYATQ6IB77 296 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52W1Q6IF63 320 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 C16orf89Q6UX73 402 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 OR11H1Q8NG94 326 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 CHST6Q9GZX3 395 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM183AA6NL82 134 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 FGF16O43320 207 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 PSPNO60542 156 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 GASTP01350 101 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 SPNP16150 400 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 CDK2P24941 298 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTA-217ENST00000560521 CD34P28906 385 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 RRM2P31350 389 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 CEACAM3P40198 252 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 MNDAP41218 407 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTA-217ENST00000560521 ESRRGP62508 458 aa6.97□□□□□ -1.29
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