RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559937.1

SMAD3-212, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-212ENST00000559937 SGPP2Q8IWX5 399 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 CCDC36Q8IYA8 594 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 POC1AQ8NBT0 407 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 OR1S1Q8NH92 325 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SUN5Q8TC36 379 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 C17orf50Q8WW18 174 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PIGCQ92535 297 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 APH1AQ96BI3 265 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SEC22AQ96IW7 307 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 CXorf58Q96LI9 332 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 AQP10Q96PS8 301 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PRRG4Q9BZD6 226 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 MBD2Q9UBB5 411 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 GLS2Q9UI32 602 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 AK3Q9UIJ7 227 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF175Q9Y473 711 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 KCNMB2Q9Y691 235 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 FAM166BA8MTA8 275 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 NUDT19A8MXV4 375 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 B8ZZF3 427 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 J3QW42 95 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ANGPTL7O43827 346 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 TNFSF15O95150 251 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 IGKV1D-12P01611 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PATE4P0C8F1 98 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 OR5H8P0DN80 308 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF250P15622 560 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 GLRA1P23415 457 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PTGER4P35408 488 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 MAGEA5P43359 124 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 RRADP55042 308 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PLP2Q04941 152 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SLC10A1Q14973 349 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 TAF9Q16594 264 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 LINC00596Q86U02 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 STPG2Q8N412 459 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 BVESQ8NE79 360 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 OR51F2Q8NH61 342 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 DCUN1D4Q92564 292 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 GALNT14Q96FL9 552 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 RNF126Q9BV68 326 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 HES7Q9BYE0 225 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 POM121CA8CG34 1229 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 MSTNO14793 375 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 TAAR5O14804 337 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 FGF16O43320 207 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 F10P00742 488 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 IFNA21P01568 189 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 GLAP06280 429 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 CELA3AP09093 270 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF728P0DKX0 622 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 GLP1RP43220 463 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 SRYQ05066 204 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 MPV17LQ2QL34 196 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 UQCC3Q6UW78 93 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-212ENST00000559937 DHRS13Q6UX07 377 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms