RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPA2Q9H2U2 334 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUX4Q9UBX2 424 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 A6NIZ1 184 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPFFO15130 113 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBDO15205 165 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 AHCYL1O43865 530 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5F1O95221 314 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 IRF2P14316 349 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 DLX1P56177 255 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAP1BP61224 184 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAP1AP62834 184 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLA2G7Q13093 441 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLRD1Q13241 179 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 SELPLGQ14242 412 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 OTPQ5XKR4 325 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM122BQ7Z309 247 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 LYG1Q8N1E2 194 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q8N2B8 174 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 STPG4Q8N801 248 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDL1Q96EA4 605 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBP7Q96R05 134 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 COQ7Q99807 217 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 B9D2Q9BPU9 175 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF702PQ9H963 129 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR76Q9H967 626 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.72□□□□□ -1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 H3BUX3 64 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0QX08 132 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RER1O15258 196 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFA2O43678 99 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSHBP01222 138 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 LHBP01229 141 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD28P10747 220 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGSF11Q5DX21 431 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 HCP5Q6MZN7 132 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PNKDQ8N490 385 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2T12Q8NG77 320 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 C17orf50Q8WW18 174 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR4F4Q96R69 305 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDRT15Q96T59 188 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABHD6Q9BV23 337 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM100Q9NV29 134 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RHCGQ9UBD6 479 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAB2Q9UQC2 676 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.71□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MEIOCA2RUB1 952 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRSS37A4D1T9 235 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GYPAP02724 150 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMBPP02760 352 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFC1BP0CG36 223 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFC1P0CG37 223 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGLL1P15814 213 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTPNP58546 118 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 VSNL1P62760 191 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACSM1Q08AH1 577 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 AANATQ16613 207 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCK2Q16822 640 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms