RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 M0R1W7 72 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 HAX1O00165 279 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 SLC1A7O00341 560 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 ZNF737O75373 536 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 MELTFP08582 738 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 PRKACBP22694 351 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 DCKP27707 260 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 ATP1B3P54709 279 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 MTCP1P56278 107 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 COL10A1Q03692 680 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 HCP5Q6MZN7 132 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 RPS4Y2Q8TD47 263 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 ZDHHC16Q969W1 377 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 RFT1Q96AA3 541 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 SPSB1Q96BD6 273 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 CLEC2DQ9UHP7 191 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PRD5 423 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PRF3 423 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PRM7 423 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 IGKV1D-12P01611 117 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 MT-ND2P03891 347 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 TK1P04183 234 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 HKR1P10072 659 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 BCL3P20749 454 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 CFPP27918 469 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 CAPGP40121 348 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 AWAT1Q58HT5 328 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 TMEM200BQ69YZ2 307 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 ASPHD2Q6ICH7 369 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 C11orf42Q8N5U0 333 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 OR4M1Q8NGD0 313 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 OR5AK2Q8NH90 309 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 SLC25A28Q96A46 364 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 OPALINQ96PE5 141 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 NOX4Q9NPH5 578 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 TNFRSF19Q9NS68 423 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CS-222ENST00000550996 TMEM82A0PJX8 343 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 K7N7A8 449 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 ANGPTL7O43827 346 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 LALBAP00709 142 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 CCDC159P0C7I6 412 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 CALCBP10092 127 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 RPL31P62899 125 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 PDZK1IP1Q13113 114 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 ZNF273Q14593 569 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 SETD9Q8NE22 299 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 GGHQ92820 318 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 DUSP1P28562 367 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 ERVFRD-1P60508 538 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 IL18R1Q13478 541 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 CDK5R1Q15078 307 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 PARP16Q8N5Y8 322 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 ZNF485Q8NCK3 441 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 OR5D18Q8NGL1 313 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 FBLIM1Q8WUP2 373 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 CHIAQ9BZP6 476 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 COMMD4Q9H0A8 199 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 FAM234AQ9H0X4 552 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 H0YAE9 185 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 NPFFO15130 113 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 XPNPEP2O43895 674 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 HAND1O96004 215 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 IGHV4-59P01825 116 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 PIPP12273 146 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 CCL3L1P16619 93 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 DLX6P56179 175 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 DOC2BQ14184 412 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 ZNF529Q6P280 563 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 C16orf87Q6PH81 154 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 C17orf107Q6ZR85 190 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 LDLRAD3Q86YD5 345 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 MKXQ8IYA7 352 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 FAM58AQ8N1B3 248 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 NRG4Q8WWG1 115 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 DHDHQ9UQ10 334 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 ALX3O95076 343 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 CHRM2P08172 466 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 SOX2P48431 317 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-222ENST00000550996 UBE2E1P51965 193 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms