RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 LGALS12Q96DT0 336 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ZNF488Q96MN9 340 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 Q96MT0 163 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 RDH12Q96NR8 316 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ZNF649Q9BS31 505 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 INPP5EQ9NRR6 644 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 A0A1W2PPH5 198 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 A0A1W2PQ09 198 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 G3V4G9 280 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ZNF737O75373 536 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 MT-ND2P03891 347 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 TK1P04183 234 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ZNF91Q05481 1191 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 RAB40BQ12829 278 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 GALEQ14376 348 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ODF4Q2M2E3 257 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 HCP5Q6MZN7 132 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 Q8IYB0 196 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 RDH10Q8IZV5 341 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 PELI1Q96FA3 418 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 CEP19Q96LK0 163 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 F8VVB4 439 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 F8VWA3 439 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 RBP4P02753 201 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 CHRM2P08172 466 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 HTR1AP08908 422 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 CSF1P09603 554 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 PRKACBP22694 351 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 SAA4P35542 130 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 RBP2P50120 134 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ATP1B3P54709 279 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 AANATQ16613 207 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 REC114Q7Z4M0 266 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 MKXQ8IYA7 352 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 BEND2Q8NDZ0 799 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 SPSB1Q96BD6 273 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 BORCS8Q96FH0 119 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 AJUBAQ96IF1 538 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 JAM3Q9BX67 310 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 AASSQ9UDR5 926 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 HHLA2Q9UM44 414 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 COL7A1Q02388 2944 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 A0A1W2PPE2 198 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 A0A1W2PR64 198 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 A0A1W2PRV1 198 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 C17orf98A8MV24 154 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 H0YAE9 185 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 J3QLW9 94 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 PIN1P1O15428 100 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 OPN1MWP04001 364 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ZNF19P17023 458 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ATF1P18846 271 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 CAPZA1P52907 286 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 DLX6P56179 175 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 KLRD1Q13241 179 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 ZNF146Q15072 292 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 KLHL22Q53GT1 634 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 LPCAT4Q643R3 524 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-221ENST00000550734 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms