RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 SYNGR4O95473 234 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 DHFRP00374 187 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-9P01782 118 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 APOC1P02654 83 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 YES1P07947 543 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 MELTFP08582 738 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ZNF735P0CB33 412 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CEACAM1P13688 526 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 B4GALT1P15291 398 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR3A4PP47883 348 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TNFSF10P50591 281 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CAPZA1P52907 286 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CASP6P55212 293 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TMEM50BP56557 158 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TMPRSS3P57727 454 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 AP3S2P59780 193 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ARG2P78540 354 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SCRN3Q0VDG4 424 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ECH1Q13011 328 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CBX3Q13185 183 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 C3AR1Q16581 482 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 LINC00303Q3SY05 128 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CDNFQ49AH0 187 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 DMRTC1Q5HYR2 192 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 DRAM2Q6UX65 266 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 UTS2BQ765I0 119 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SLC16A14Q7RTX9 510 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 NOXA1Q86UR1 476 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR56B4Q8NH76 319 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 FNDC9Q8TBE3 224 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SPTSSAQ969W0 71 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 FAM46BQ96A09 425 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CMBLQ96DG6 245 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CYYR1Q96J86 154 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SPACA5Q96QH8 159 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 BEX2Q9BXY8 128 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PRRG4Q9BZD6 226 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 LPAR5Q9H1C0 372 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR10A4Q9H209 315 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR51J1Q9H342 316 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CALHM2Q9HA72 323 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 NUDT15Q9NV35 164 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 COPZ2Q9P299 210 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PEMTQ9UBM1 199 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ZNF69Q9UC07 566 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TTC28Q96AY4 2481 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 LOC100509620A0A075B734 347 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PP11 408 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ZNF587BE7ETH6 402 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TSPAN4O14817 238 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SOCS1O15524 211 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ZNHIT1O43257 154 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SLC25A17O43808 307 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SSX5O60225 188 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CEACAM4O75871 244 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TGM6O95932 706 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 IGHG3P01860 377 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CD74P04233 296 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CD3DP04234 171 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 IL5P05113 134 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 FCER2P06734 321 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ACKR3P25106 362 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 RAD52P43351 418 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ALDH3B1P43353 468 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 VEGFCP49767 419 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PCBD1P61457 104 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PMP22Q01453 160 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 DEFB109BQ30KR1 87 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 Q5BKY6 102 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TMEM42Q69YG0 159 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 Q6ZTK2 550 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 MOB3CQ70IA8 216 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 COMMD2Q86X83 199 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 GABRG1Q8N1C3 465 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TMEM229BQ8NBD8 167 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TMEM178AQ8NBL3 297 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms